2020年3月10日，由国家卫生健康委临床检验中心李金明教授、北京市临床检验中心王清涛教授、北京大学人民医院检验科贾玫教授牵头制定的《高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识（第一版肿瘤部分）》（以下简称“专家共识”）在《中华医学杂志》第100卷第9期刊出，该共识是国内首次为肿瘤NGS基因检测规范化而制定的权威专家共识。作为肿瘤精准医疗领域的领先企业，不朽情缘MG官网受邀参与了专家共识的执笔撰写工作。
近年来，高通量测序（NGS）在实体肿瘤体细胞基因突变中展现了其广阔的应用场景。然而，NGS检测流程复杂，对实验室环境条件、人员能力及质量管理要求高，给实验室检测带来了重大挑战。为此，国家卫生健康委临床检验中心李金明教授、北京市临床检验中心王清涛教授等专家牵头，联合共识制定专家组成员制定了专家共识，推动了肿瘤基因突变高通量测序技术临床应用的规范化、标准化，具有重要的行业指导意义。
北京专家共识肿瘤部分从肿瘤体细胞基因突变NGS检测实验室建设总体要求和检测流程的建立与质量保证两个方面，对实验室分区、实验室人员及能力要求、临床预期用途、NGS 方法学建立及其关键环节的优化、性能验证或性能确认、实验室检测SOPs 的建立等内容进行了详细阐述，形成8项共识。
共识1：实体肿瘤体细胞突变检测通常分析敏感性较高，临床实验室应尤其注意合理分区，以防止污染。杂交捕获法NGS建议的分区包括试 剂准备区、样本制备前区、样本制备区、打断区、电泳区、文库制备区、扩增一区、杂交捕获区、扩增二区和测序区。但是不同检测流程，分区设置有所不同，临床实验室应根据“通用共识”的“32字原则” 来考虑实验室分区设置。若实验室同时检测血浆和组织或细胞学两类样本，则需设置不同的样本制 备区及其后续的文库制备过程中的相应区域。
共识2：NGS实验室负责人或技术负责人应有全面的NGS及其实验室质量管理知识。采用组织样本进行检测的实验室，“湿实验”团队成员应包括病理医（技）师人员。生物信息学分析团队中应有具备临床肿瘤学和临床分子检测基本知识的人员。签发报告人员应具备医学分子生物学和临床肿瘤学知识背景，熟练使用相关数据库，掌握本领域的指南，了解相关研究的最新进展。对于疑难病例或必要时，可由不同专业的专家组成的分子肿瘤专家组给出个体化治疗方案。使用LDTs的实验室，应配备“湿实验”和“干实验”研发人员，其应具有正确设定肿瘤体细胞突变NGS检测临床预期用途、建立检测系统（含试剂配制和生物信息分析流程搭建等）及其使用SOPs以及完成LDTs性能确认的能力。
共识3：实体肿瘤体细胞基因突变NGS检测的临床预期用途为通过体细胞基因突变检测选择可能在靶向或免疫治疗药物使用中受益的患者以及耐药监测。临床实验室应在预期用途中包括但不限于适用人群、样本类型、检测基因及其突变位点或突变类型和检测的临床意义等。在NGS方法学建立和优化阶段，实验室需根据临床预期用途，选择具有临床意义的待测基因位点；优化核酸提取方法，所提取核酸的质量应满足检测要求；建立和优化文库制备方法；对测序平台进行性能确认，建立测序平台检测不同突变类型的性能指标；搭建和优化生物信息学分析流程，确定测序深度和阳性判断值，并对生物信息学分析流程进行性能确认。
共识4：使用NMPA批准的NGS试剂进行检测前应进行分析性能验证；LDTs试剂应根据临床预期用途进行试剂方法的设计和优化，至少要对体细胞基因突变的识别策略、样本前处理、核酸提取、文库制备、靶向捕获、高通量测序平台、生物信息学分析、测序深度和阳性判断值等环节进行确认。在完成试剂方法的设计和优化后，实验室应对LDTs检测的全流程进行整体的性能确认。分析性能确认应至少证明NGS对各种不同突变类型的检测能力，证明对重要常见基因的检测能力。如果临床实验室可接收多个样本类型，那么对每种样本类型均需分别进行性能确认。没有足够的临床样本，可以使用模拟样本来代替。分析性能确认包括但不限于精密度、准确度、分析敏感性、分析特异性和可报告范围等。在确认分析性能特征可以满足临床预期用途后，最终完成建立“湿实验”试剂配制和“干实验”生物信息学分析流程SOPs。对预期用途为伴随诊断的NGS检测需进行临床性能确认。性能评价应包含检测范围内样本类型和突变类型。通过性能评价，建立性能参数，明确检测的局限性。若实验室流程发生改动，需根据对检测的影响进行全面或部分性能确认。
共识5：实验室应制定每一种类型样本采集、运送、接收和保存的SOPs，明确样本接收和拒收标准，建立合适的样本运输和保存要求。适用于肿瘤基因突变NGS检测的样本主要包括FFPE、血 浆、新鲜组织、胸腹水等。采用FFPE、胸腹水细胞沉淀或新鲜组织进行NGS检测前，需先评估样本质量和肿瘤细胞的含量。为避免交叉污染，切片制备过程中，应使用一次性耗材。血浆样本采集、运送、接收和保存的核心是避免外周血有核细胞裂解释放基因组DNA稀释游离DNA或游离DNA降解。分析前记录的关键点为样本接收、拒收和预处理的记录。当样本质量未达到SOPs要求时，可进行让步检测，但应建立对应的异常情况处理程序。
共识6：实验室应根据性能确认或性能验证的结果，建立分析中检测的标准操作程序。各环节的质量标准是标准操作程序的重要组成，包括核酸提取后，核酸浓度、核酸纯度和核酸的片段分布要求，文库制备的DNA上样量和文库制备后进行杂交捕获上样量的要求，最低测序深度、平均测序 深度、覆盖均一性、GC含量、碱基识别质量值、比对质量值和在靶率等要求，这些要求也同时是分析中实验记录的关键点。若某一关键环节的检测质量 控制参数不符合要求，则实验室应根据所建立的异常情况的处理程序进行处理。此外，实验室应根据可检测的样本类型、突变类型、检测下限等设置合适的包括所检测的所有突变类型的弱阳性、阴性和无模板对照（如水样本）质控品，且与待检样本同批检测。定期参加EQA/PT或进行实验室间比对等。出现失控，应分析失控原因，并采取相应的纠正措施和预防措施。
共识7：肿瘤体细胞基因突变NGS检测结果报告应对检测方法进行详细说明。肿瘤体细胞基因突变可以分为临床意义明确、有潜在临床意义、临床意义不明确和良性或可能良性突变四级，临床证据等级有A、B、C和D级。实验室需要建立分级和报告的SOPs，明确对体细胞基因突变进行分级的流程和在日常检测中报告哪一级或哪几级突变位点。分级的流程应有记录，包括证据来源的指南、文献、数据库、证据等级、分级结果等。
共识8：实验室应对体细胞基因突变药物疗效预测的临床意义进行解释。实验室应制定结果解释的SOPs，并遵循准确、及时和充分的原则。在需要的情况下，临床实验室应给出进一步检测的建议。由于样本质量或其他质量要求未达到，但样本有限的情况进行的让步检测，也应在报告中进行说明。与肿瘤无关的意外发现因难以解释，建议不在检测报告中进行呈现。在对如结直肠癌、卵巢 癌、胰腺癌和乳腺癌等具有遗传倾向的肿瘤进行NGS检测时，需结合家族史，考虑是否为遗传性肿瘤，并建立遗传咨询流程。
需要强调的是，在肿瘤基因突变NGS检测流程的建立与质量保证方面，专家共识建议，在测序平台的使用上，实验室应优先选择NMPA批准的测序仪和配套试剂盒，并根据所选定的基因panel，并综合考虑测序通量、测序数据准确度、可支持读长、运行时间、测序成本等选择测序平台型号。
作为专家共识撰写单位之一，不朽情缘MG官网立足国产NGS平台，打造了从样本制备、上机测序、分析解读、数据挖掘等覆盖肿瘤NGS检测全流程的标准产品服务。不朽情缘MG官网自主品牌的Gene+Seq-200/2000基因测序仪和人EGFR/KRAS/ALK基因突变检测试剂盒已获得国家药品监督管理局颁发的三类医疗器械注册证，Gene+OncoBox肿瘤NGS分析解读一体机配套软件也已获得二类证书。凭借三证齐全的优势，能为肿瘤NGS入院提供全流程的一体化服务支撑。目前，公司标准化、合规化的国产高通量测序一体化解决方案也进入多家医院，助力肿瘤NGS检测的临床应用落地。
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此外，不朽情缘MG官网医学检验实验室作为国家卫健委批准成立的第三方独立医学检验实验室，连续四年以优异成绩通过NCCL、CAP、EMQN等国内外权威机构的室间质评和能力验证项目，并获得CAP证书。实验室建立了从样本管理、样本制备、上机测序，到信息分析、数据解读、报告发放的全流程信息化管理体系，实现了数据分析与解读的全自动化，是标准化、专业化的国产高通量测序实验室。
不朽情缘MG官网医检实验室满分通过NCCL、CAP、EMQN等多项室间质评和能力验证